Doktorand i epigenetik och kromatindynamik
Lund University · Lund · Tidsbegränsad anställning · Deadline 2026-11-13
Lunds universitet söker en **doktorand i epigenetik och kromatindynamik** för en tidsbegränsad anställning på heltid i fyra år, med placering i Lund och planerat tillträde den 1 december 2026 eller enligt överenskommelse. Huvuduppgiften är att genomföra forskarutbildningen inom ett projekt som undersöker epigenetisk reglering av repetitiva och transposabla element i den mänskliga hjärnan vid utveckling och sjukdom. Arbetet kräver en **balans mellan våtlabb och bioinformatik** och omfattar metoder som iPSC-odling, RNA-seq, CUT&RUN/Tag, Oxford Nanopore-sekvensering samt co-immunoprecipitering eller proteomik. Viss handledning av kandidat- eller masterstudenter kan också ingå. Behörighet kräver examen på avancerad nivå, minst 240 högskolepoäng (varav minst 60 på avancerad nivå) eller motsvarande förvärvade kunskaper. För anställningen krävs **erfarenhet av funktionell epigenomik eller kromatinbiokemi** samt stamcellsodling och differentieringsmodeller. Den sökande måste ha mycket goda kunskaper i molekylärbiologi, molekylärgenetik och engelska i tal och skrift, samt visa ett tydligt intresse för repetitiva delar av genomet. Meriterande är erfarenhet av long-read-sekvensering, proteinbiokemi samt tidigare samarbete i ambitiösa forskningsprojekt.
Organisation: Lunds universitet
Beskrivning av arbetsplatsen
Laboratoriet för epigenetik och kromatindynamik vid Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap (Medicinska fakulteten) bedriver forskning om den epigenetiska regleringen av repetitiva och transposabla genetiska element – så kallad ”genomisk mörk materia” – vid mänsklig hjärnutveckling och sjukdom. Gruppen består av åtta forskningsaktiva medlemmar och leds av Dr. Christopher Douse. Vi fascineras av hur dessa bristfälligt utforskade delar av det mänskliga genomet bidrar funktionellt till mänsklig neurobiologi och neurologiska sjukdomar. Vårt arbete integrerar avancerade metoder inom både experimentell forskning (”wet lab”) och bioinformatisk analys (”dry lab”). Mer information finns Här. Som arbetsplats värnar vi om en god arbetsmiljö, präglad av respekt och hänsyn i våra relationer till varandra.
Vi arbetar utifrån följande kärnvärderingar: Equity – alla i gruppen är värdefulla och bidrar, och det finns inga dumma frågor. People-centric – vårt arbete bygger på samarbete, och vi kommunicerar öppet med varandra, det vetenskapliga samfundet och omvärlden. Integrity – vi tar inga genvägar och lägger stor vikt vid reproducerbarhet och noggrannhet i våra data. Curiosity – vi är ödmjuka inför det vi ännu inte vet, söker aktivt återkoppling och är öppna för nya idéer. Diversity – vi bedriver bättre forskning när vi har en mångfald av bakgrunder och vetenskaplig expertis.
Projektbeskrivning
För närvarande fokuserar vi särskilt på tre typer av element som är repetitiva på olika sätt, men som förenas av sin betydelse för den mänskliga hjärnans funktion och sjukdomar: klustrade protocadherin-gener, virusliknande sekvenser som kallas retrotransposoner, samt CGG-mikrosatelliter (tandemupprepningar). I samtliga fall finns betydande kunskapsluckor gällande den epigenetiska kontrollen och påverkan av dessa element. Vilka faktorer binder till och reglerar dessa repetitiva element i neurala cellinjer? Hur påverkar de funktionellt epigenomet, den lokala transkriptionsdynamiken och sjukdomsrelaterade egenskaper? För att besvara dessa frågor kommer vi att kombinera kromatinbiokemi och banbrytande funktionell epigenomik med avancerade neurala cellmodeller och skräddarsydda bioinformatiska analyser. På så sätt kommer vi att upptäcka ny, grundläggande mänsklig neurobiologi och få välbehövliga insikter om de mekanismer som ligger till grund för neurologiska sjukdomar kopplade till repetitiva element. Detta doktorandprojekt kommer att kombinera kromatinbiokemi med funktionell (epi)genomik i stamcellsmodeller av den mänskliga hjärnan. Projektet kräver en balans mellan experimentellt laboratoriearbete (”wet lab”) och bioinformatiska analyser (”dry lab”).
Doktoranden kommer specifikt att använda följande metoder:
- Stamcellsodling (iPSC:er, 2D- och 3D-kulturer av neurala progenitorceller)
- RNA-seq, CUT&RUN/Tag, Oxford Nanopore-sekvensering (cDNA, DiMeLo-seq) samt tillhörande bioinformatiska analyser
- Co-immunoprecipitation och/eller proteomik baserad på närhetsmärkning (proximity labelling)
Vi erbjuder
Lunds universitet är en statlig myndighet vilket innebär att du får särskilda förmåner, generös semester och en förmånlig tjänstepension. Läs mer på universitetets webbplats om att vara anställd hos oss Jobba hos oss
Arbetsuppgifter och ansvarsområden
Huvudarbetsuppgifterna för en doktorand är att ägna sig åt sin forskarutbildning och därför kommer du både vara antagen som student och anställd vid Lunds universitet. Utöver dina heltidsstudier på forskarnivå kan du komma att delta i handledning av kandidat- eller masterstudenter.
Kvalifikationer
Krav för antagning är:
- avlagd examen på avancerad nivå, fullgjorda kursfordringar om minst 240 högskolepoäng, varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller på något annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper
- förmåga att tillgodogöra sig utbildningen på forskarnivå
Krav för anställningen är:
- erfarenhet av funktionell (epi)genomik och/eller kromatinbiokemi
- erfarenhet av stamcellsodling och differentieringsmodeller
- ett tydligt visat intresse för repetitiva delar av genomet, hos människa eller modellorganismer, genom tidigare erfarenhet eller såsom beskrivet i personligt brev eller vid intervju
- mycket goda kunskaper i molekylärbiologi och molekylärgenetik
- mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift
- god analytisk förmåga samt ett självständigt och problemlösningsorienterat arbetssätt
- ett öppet och samarbetsinriktat förhållningssätt till forskning, i linje med forskargruppens värderingar som beskrivs ovan
Meriterande för anställningen är:
- ett välorganiserat och självgående arbetssätt
- erfarenhet av long-read-sekvensering
- erfarenhet av proteinbiokemi
- erfarenhet av att arbeta tillsammans med andra i ambitiösa forskningsprojekt
- förmåga att ta emot konstruktiv återkoppling samt en vilja att utvecklas och lära under forskarutbildningen
Övrigt
Tidsbegränsad anställning fyra år enligt HF 5 kap 7§. Startdatum den 1 december 2026 eller enligt överenskommelse.
Så här söker du
Ansökan ska innehålla ett personligt brev som motiverar ditt intresse för tjänsten och hur det matchar dina kvalifikationer. Ansökan ska även innehålla ett CV, examensbevis eller motsvarande och alla andra dokument som du vill uppmärksamma (kopior av betygsutskrifter, uppgifter om referenter, rekommendationsbrev, etc.) Kandidater kommer att övervägas löpande under ansökningsperioden.
Om Medicinska fakulteten
Medicinska fakulteten är ett verksamhetsområde inom Lunds universitet, med ansvar för utbildning och forskning inom medicin, vård och hälsa. Utbildningen sker i nära samverkan med sjukvården och är väl förankrad i fakultetens starka forskningstradition. Fakultetens forskning spänner över ett brett fält inom experimentell grundforskning, patientnära klinisk forskning och hälsovetenskaplig forskning. Medicinska fakulteten, med drygt 1800 anställda och 3000 studenter i Lund, Malmö och Helsingborg, är en kunskapsintensiv mötesplats för studenter, lärare och forskare från hela världen.
Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.
Jobbfakta
Fält – Värde
Anställningsform – Tidsbegränsad anställning
Tillträde – 2026-12-01
Löneform – Månadslön
Antal lediga befattningar – 1
Sysselsättningsgrad – 100
Ort – Lund
Län – Skåne län
Land – Sverige
Referensnummer – PA2026/3067
Kontakt – Christopher Douse, Forskargruppschef, christopher.douse@med.lu.se; Johanna Dahlin, HR-partner, johanna.dahlin@med.lu.se
Facklig företrädare – SEKO: Seko Civil, 046-2229366, sekocivil@seko.lu.se; OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-2229362, st@st.lu.se; SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-2220000, kansli@saco-s.lu.se
Publicerat – 2026-10-23
Sista ansökningsdag – 2026-11-13