Forskare i hybridisering och copy number variation
Lund University · Lund · Tillsvidareanställning · Deadline 2026-11-16
Lunds universitet söker en **forskare i hybridisering och copy number variation** för en karriärutvecklingstjänst tidigt i forskarkarriären inom Runemarklabbet. Tjänsten avser en **heltidsanställning tillsvidare** i Lund med preliminärt tillträde i december 2026, där sex månaders provanställning kan tillämpas. Arbetet ingår i ett forskningsprojekt kring hur genuttryck och strukturella varianter bidrar till evolutionär anpassning vid hybridisering, med fokus på jästhybrider under stressförhållanden och repeterad meios. Huvuduppgifterna består av bioinformatisk analys av copy number variation (CNV) och genomiska prediktorer, analys av effekter på genuttryck, tolkning av resultat samt syntetisering för vetenskaplig publicering i nära samarbete med forskarteamet. Undervisning inom bioinformatikprogrammet kan också förekomma. Behörig är den som har **doktorsexamen inom evolutionär genomik** eller en utländsk examen som bedöms likvärdig. Rollen kräver stark erfarenhet av bioinformatik inklusive hybridgenom, expertis inom detektion och analys av CNV samt erfarenhet av att utveckla statistiska metoder och bioinformatiska verktyg. Den sökande måste också behärska analys av stora genomiska och transkriptomiska dataset i R, Perl och Unix, samt ha erfarenhet av att självständigt driva ett mikrobiellt laboratorium under en kortare period. Meriterande är dokumenterat högkvalitativ forskning, starka anslagsansökningar och bioinformatisk erfarenhet av metylering, histonmodifiering eller genuttrycksdata.
Organisation: Lunds universitet
Ämnesbeskrivning
Vi rekryterar en forskare tidigt i karriären för en karriärsutvecklingsposition inom Runemarklabbet, med arbete i VR-projektet “The role of novel patterns of gene expressoin in hybrid adaptation”.
Projektet undersöker genuttryckets roll i hur ny variation och evolutionära anpassningar kan uppstå genom hybridisering. Projektets huvudfråga gäller hur strukturella varianter, i synnerhet copy number variation (CNV) bidrar till detta.
Vi samlar för närvarande prover till ett unikt dataset av jästhybrider och deras founder strains under flera stressförhållanden och repeterad meios för att bredda vår insikt inom detta fält.
Forskaren kommer att samarbeta nära med kollegor, genomföra analyser av strukturella varianter i föräldraarter och hybrider med fokus på copy number variation och dess effekter på genuttryck, samt syntetisera arbetet för publikation.
Forskaren kommer att arbeta nära HybridExpress-teamet bestående av en labmanager, en doktorand och två post docs. Det kommer att finnas möjligheter till mentorskap. Projektet leds av universitetslektor Anna Runemark vars labb är en del av SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen inom divisionen biologisk mångfald och evolution.
Arbetsuppgifter
De huvudsakliga uppgifterna i en forskartjänst är att bedriva forskning.
Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna:
- Bioinformatisk analys av CNV och genomiska prediktorer för CNVs, inklusive transposabla element och metylering
- Analys av CNV-variation i hybrider och föräldraarter med fokus på deras effekter på genuttryck
- Tolkning av bioinformatiska resultat, figurberedning
- Syntetisera data för publicering
Kandidaten kan potentiellt bidra till undervisningen på bioinformatikprogrammet.
Krav för anställningen
För anställning till denna karriärutvecklingstjänst krävs att den sökande har en doktorsexamen, eller en internationell examen som bedöms likvärdig med en doktorsexamen, inom evolutionär genomik. Även om det inte finns några formella krav på karriärålder, syftar tjänsten till karriärutveckling för en forskarkarriär och meriter kommer att beaktas i ljuset av karriäråldern.
Övriga krav är:
- Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av hybridgenom.
- Expertis i att detektera och analysera copynumber variation och att undersöka dess funktionella och evolutionära signifikans.
- Erfarenhet av att utveckla statisktiska metoder och bioinformatiska verktyg för analys av genomisk data.
- Färdighet i att analysera stora genomiska och transkriptomi dataset med R, Perl och Unix.
- Erfarenhet av att självständigt driva ett mikrobiskt laboratorium under kortare tid.
Meriterande för anställningen
Detta är en position menad för karriärsutveckling för en framtida akademisk karriär med forskningsfokus. Positionen är tänkt som ett tidigt steg i en karriär och utvärdering av sökande kommer primärt baseras på deras forskningskvalifikationer och potential som forskare. Särskild tyngd kommer läggas på färdigheter inom forskningsämnet i.e., hybridiseringsgenomik i synnerhet analys av strukturella varianter i form av copy number variants.
- God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet, vilket bedöms av publikationshistorik med starka självständiga bidrag och publikationer av hög kvalitet; samt demonstrerad förmåga att kommunicera forskningsresultat på internationella konferenser.
- Ett starkt track-record av att utveckla egen forskning, vilket bedöms av uppvisande av högt meriterade anslagsansökningar.
- Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av metylering och histonmodifiering, genuttrycksdata och/eller analys av hybridgenom.
Övriga egenskaper som kommer tas i beaktande är goda samarbetsegenskaper, handlingskraftighet och självständighet, samt hur sökandens erfarenhet och färdigheter kompletterar den pågående forskningen inom institutionen och dess utveckling.
Villkor
Detta är en tillsvidareanställning på heltid, med start 2026-12-15, provanställning i 6 månader kan komma att tillämpas.
Kontaktperson: Anna Runemark, anna.runemark@biol.lu.se
Instruktioner för ansökan
Ansökan ska skrivas på engelska, kompileras till en enda pdf och innehålla:
- Meritförteckning/CV (max 1 sida Times New Roman, 12 pt)
- Publikationslista
- Ett cover letter som beskriver hur din tidigare forskning matchar positionens krav samt om framtida forskningsintressen (max 1 sida Times New Roman, 12 pt)
- Kontaktuppgifter till minst två akademiska referenser
- Kopia av examensbevis för doktorsexamen
Vid Naturvetenskapliga fakulteten bedrivs forskning och utbildning inom astronomi, biologi fysik, geovetenskap, kemi, matematik, medicinsk strålningsfysik, miljövetenskap och naturgeografi. Verksamheten bedrivs inom norra universitetsområdet. Fakulteten har ca 1 900 studenter, 330 forskarstuderande och 730 anställda.
Vi undanber oss alla kontakter från annonsförsäljare, rekryterings- och bemanningsföretag på grund av statliga upphandlingsregler.
Jobbfakta
Fält – Värde
Anställningsform – Tillsvidareanställning
Anställningens omfattning – Heltid
Tillträde – Preliminärt 2026-12-15 eller enligt överenskommelse
Löneform – Månadslön
Antal lediga befattningar – 1
Sysselsättningsgrad – 100
Ort – Lund
Län – Skåne län
Land – Sverige
Referensnummer – PA2026/3098
Kontakt – Anna Runemark, Universitetslektor, +46462229014, anna.runemark@biol.lu.se
Facklig företrädare – SEKO: Seko Civil, 046-2229366, sekocivil@seko.lu.se; OFR/ST:Fackförbundet ST:s kansli, 046-2229362, st@st.lu.se; SACO:Saco-s-rådet vid Lunds universitet, 046-2220000, kansli@saco-s.lu.se
Publicerat – 2026-11-02
Sista ansökningsdag – 2026-11-16