Postdoktor inom strukturbaserad läkemedelsdesign med maskininlärning
Uppsala University · Uppsala · Tidsbegränsad anställning · Deadline 2026-11-23
Uppsala universitet anställer en **postdoktor inom strukturbaserad läkemedelsdesign med maskininlärning** till forskargruppen ledd av Jens Carlsson. Det rör sig om en **tidsbegränsad anställning på heltid i två år** med placering i Uppsala och tillträde i januari 2027 eller enligt överenskommelse. Projektets mål är att utveckla och tillämpa strukturbaserade screeningmetoder för att identifiera ligander till peptidbindande receptorer. Arbetsuppgifterna innebär att använda molekylär dockning och maskininlärning för att söka igenom stora kombinatoriska bibliotek av peptider och peptidomimetika samt naturligt förekommande peptidsamlingar, vilket även innefattar samarbete med experimentella forskargrupper inom projektet Biodiversity2Drugs. Behörighetskravet är en **doktorsexamen i beräkningskemi** eller en utländsk examen som bedöms motsvara denna, avlagd senast vid tidpunkten för anställningsbeslutet. Främst beaktas den som har disputerat för högst tre år sedan räknat från sista ansökningsdag, med undantag för särskilda skäl såsom föräldraledighet eller sjukdom. Tjänsten kräver kompetens inom beräkningskemi med dokumenterad erfarenhet av kemoinformatik och strukturbaserad liganddesign, goda kunskaper i molekylär dockning eller co-folding-metoder, erfarenhet av kemiska bibliotek samt goda kunskaper i engelska i tal och skrift. Erfarenhet av maskininlärning, programmering och strukturbaserad modellering av receptorer och peptider är meriterande. Anställningen kan komma att säkerhetsprövas.
Organisation: Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi
Är du intresserad av att utveckla metoder för att upptäcka nya läkemedel med hjälp av datorsimuleringar? Vi välkomnar din ansökan till en postdoktortjänst i den internationella och vetenskapligt framstående forskningsmiljön vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Uppsala universitet.
Institutionen för cell- och molekylärbiologi (https://icm.uu.se) är organiserad i sju forskningsprogram med inriktning på beräkningsbiologi och bioinformatik, mikrobiologi och immunologi, molekylärbiologi, molekylär biofysik, molekylär evolution, molekylär systembiologi och strukturbiologi.
Tjänsten är placerad i forskargruppen som leds av professor Jens Carlsson och som ingår i forskningsprogrammet för beräkningsbiologi och bioinformatik. Carlssons forskargrupp utvecklar och tillämpar modelleringsmetoder för att studera molekylära interaktioner mellan proteiner och ligander, särskilt hur receptorer och enzymer binder läkemedel. G-proteinkopplade receptorer är ett centralt forskningsområde för gruppen eftersom de spelar viktiga roller i fysiologiska processer. Forskargruppen använder strukturbaserade modeller för att förstå de molekylära mekanismerna bakom receptorsignalering och för att designa ligander till dessa farmakologiskt viktiga målproteiner, ofta i nära samarbete med experimentella forskare. Carlssons forskargrupp är internationell och också en del av Science for Life Laboratory (http://www.scilifelab.se/). Besök forskargruppens webbplats (www.carlssonlab.org) för mer information.
Arbetsuppgifter
Projektets huvudsakliga mål är att utveckla och tillämpa strukturbaserade screeningmetoder för att identifiera ligander till peptidbindande receptorer i stora kemiska bibliotek. Inom projektet kommer molekylär dockning och maskininlärningsmetoder att användas för att söka efter ligander i kombinatoriska bibliotek av peptider och peptidomimetika, samt i samlingar av naturligt förekommande peptider från mikroorganismer, växter och djur. Arbetet omfattar också samarbeten med experimentella forskargrupper inom projektet Biodiversity2Drugs (https://www.biodiversa.eu/2025/04/08/biodiversity2drugs/), som fokuserar på att identifiera bioaktiva peptider som påverkar receptorer med terapeutisk relevans.
Kvalifikationskrav
Doktorsexamen i beräkningskemi eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i beräkningskemi. Examen ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. Främst bör den komma ifråga som har avlagt examen för högst tre år sedan. Vid beräkning av ramtiden om tre år är utgångspunkten sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan sådan examen ha avlagts tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, etc.
Kompetens inom beräkningskemi, med dokumenterad erfarenhet av kemoinformatik och strukturbaserad liganddesign, är ett krav. Goda kunskaper i molekylär dockning eller co-folding-metoder för att förutsäga protein–ligandkomplex samt erfarenhet av att arbeta med kemiska bibliotek är ett krav. Goda skriftliga och muntliga kunskaper i engelska är ett krav eftersom arbetet sker i en internationell miljö. Vi lägger stor vikt vid personliga egenskaper såsom god samarbetsförmåga, kreativitet, motivation och självständighet.
Önskvärt/meriterande i övrigt
Erfarenhet av maskininlärning, programmering och strukturbaserad modellering av receptorer och peptider är meriterande men inget krav.
Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad i två år enligt centralt kollektivavtal. Omfattningen är heltid. Tillträde 2027-01-01ellerenligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala.
Upplysningar om anställningen lämnas av: Jens Carlsson, jens.carlsson@icm.uu.se, Tel: +46 (0)72 227 7976.
I denna rekrytering har vi ersatt det personliga brevet med frågor som du besvarar i samband med din ansökan. Svaren kommer att användas som en del i urvalsprocessen.
Välkommen med din ansökan senast den 23 November 2026, UFV-PA 2026/3253.
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/
Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Fackliga företrädare: Saco-S - saco-s@uu.se, Seko - seko@uadm.uu.se, ST (OFR/S) - ofr@uu.se
Jobbfakta
Fält – Värde
Anställningsform – Tidsbegränsad anställning
Anställningen avslutas – 2028-12-31
Anställningens omfattning – Heltid
Tillträde – 2027-01-01
Löneform – Individuell lönesättning
Antal lediga befattningar – 1
Sysselsättningsgrad – 100
Ort – Uppsala
Län – Uppsala län
Land – Sverige
Referensnummer – UFV-PA 2026/3253
Publicerat – 2026-10-27
Sista ansökningsdag – 2026-11-23